论文在知网查重系统中的提交流程包括：1.登录知网查重系统；2.选择查重类型；3.上传论文文件；4.确认提交并等待系统处理。在提交过程中，需要注意论文格式、文件大小等要求。

论文在知网查重系统中的检测流程包括：1.系统自动检测；2.生成查重报告；3.分析查重结果；4.优化论文并重新提交。在检测过程中，需要仔细阅读查重报告，对于重复率高的部分进行修改和引用标注。